MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 2469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	CGG	2	6	1710	1715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016025	TTG	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016025	GCG	2	6	1785	1790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016025	GGCCG	2	10	1803	1812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016025	CGT	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016025	GGC	2	6	4968	4973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016025	GT	3	6	4988	4993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016025	CG	3	6	6264	6269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016025	CCGT	2	8	6315	6322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016025	GGT	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016025	GGCCG	2	10	6388	6397	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016025	AAC	2	6	6412	6417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016025	GGT	2	6	7414	7419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016025	GGGCGG	2	12	7425	7436	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016025	AGG	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016025	AGC	2	6	14946	14951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016025	GCCG	2	8	15074	15081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016025	A	7	7	15094	15100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016025	CAAA	2	8	15176	15183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016025	TGC	2	6	15241	15246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016025	CTG	2	6	15267	15272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016025	GTGGC	2	10	15310	15319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016025	TTGACC	2	12	15344	15355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016025	ACTGC	2	10	15389	15398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016025	A	6	6	17283	17288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016025	GC	3	6	17292	17297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016025	GC	3	6	17307	17312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016025	TGG	2	6	17327	17332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016025	CAG	2	6	17350	17355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016025	TCC	2	6	17784	17789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016025	AAG	2	6	17791	17796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016025	TG	3	6	17797	17802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016025	ACC	2	6	18489	18494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016025	TGG	2	6	18753	18758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016025	CTTT	2	8	18790	18797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016025	AAG	2	6	18809	18814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016025	GGA	2	6	19586	19591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016025	TG	3	6	20865	20870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016025	TGGG	2	8	23080	23087	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016025	GCGG	2	8	23107	23114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016025	T	6	6	23124	23129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016025	T	6	6	23144	23149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016025	GGT	2	6	23167	23172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016025	CGG	2	6	23237	23242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016025	GGCG	2	8	25299	25306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016025	GC	3	6	25316	25321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016025	GC	3	6	27034	27039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016025	CCGG	2	8	28458	28465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016025	AAC	2	6	28479	28484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016025	TGA	2	6	31119	31124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016025	GCC	2	6	32501	32506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016025	GTTC	2	8	34130	34137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016025	ATG	2	6	34878	34883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016025	GGCA	2	8	34889	34896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016025	AAGC	2	8	36377	36384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016025	GCC	2	6	36396	36401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016025	CCA	2	6	36447	36452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016025	GTTTT	2	10	37836	37845	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016025	GGC	2	6	37848	37853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016025	T	6	6	37951	37956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016025	TCAG	2	8	37963	37970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016025	TGA	2	6	38046	38051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016025	C	6	6	38067	38072	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_016025	TGC	2	6	38087	38092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016025	AGCC	2	8	38096	38103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016025	TGG	2	6	38148	38153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016025	TG	3	6	38162	38167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016025	CAT	2	6	38226	38231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016025	AGG	2	6	38237	38242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016025	CG	3	6	38269	38274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016025	GT	3	6	38286	38291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016025	ACTC	2	8	41593	41600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016025	TGCC	2	8	45693	45700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016025	CG	3	6	45740	45745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016025	CTCC	2	8	46513	46520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_016025	GGT	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016025	CAGC	2	8	48710	48717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016025	TCAGAA	2	12	48738	48749	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016025	CTGG	2	8	48783	48790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016025	GAG	2	6	50102	50107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016025	CGG	2	6	53692	53697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016025	GCG	2	6	53732	53737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016025	TGGC	2	8	53738	53745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016025	TGC	2	6	53760	53765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016025	GCGCG	2	10	53809	53818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016025	GTG	2	6	53887	53892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016025	GACGG	2	10	53931	53940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016025	ATG	2	6	53944	53949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016025	CTGC	2	8	53985	53992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016025	T	7	7	54041	54047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016025	GCCC	2	8	54076	54083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_016025	CG	3	6	54104	54109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016025	ACCA	2	8	54131	54138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016025	TCTG	2	8	54162	54169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016025	GC	3	6	54197	54202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016025	CGTG	2	8	58981	58988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016025	TC	3	6	59020	59025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016025	TCT	2	6	60012	60017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016025	ATT	2	6	60035	60040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016025	GAC	2	6	60268	60273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016025	GCA	2	6	60304	60309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016025	TGCC	2	8	60379	60386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016025	CCTTC	2	10	60440	60449	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016025	CAT	2	6	60532	60537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016025	TTGAA	2	10	60594	60603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016025	CGA	2	6	60748	60753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016025	C	7	7	60853	60859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_016025	AAG	2	6	60926	60931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016025	TGA	2	6	60979	60984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016025	T	8	8	60994	61001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016025	GAA	3	9	61013	61021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016025	AG	3	6	61061	61066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016025	CTT	2	6	61118	61123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016025	TC	3	6	61142	61147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016025	GCC	2	6	61459	61464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016025	CAG	2	6	61481	61486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016025	CGGAA	2	10	61513	61522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016025	GGC	2	6	64395	64400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016025	GCT	2	6	64416	64421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016025	CCA	2	6	64429	64434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016025	AC	3	6	65834	65839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016025	TCT	2	6	65903	65908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016025	TCC	2	6	69790	69795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016025	GTGAT	2	10	69815	69824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016025	TTC	2	6	69846	69851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016025	GCAA	2	8	69961	69968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016025	TTGT	2	8	71758	71765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016025	CAG	2	6	71804	71809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016025	T	6	6	74831	74836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016025	ATGGCA	2	12	74886	74897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016025	TTG	2	6	76590	76595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016025	TGC	2	6	76665	76670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016025	CCG	2	6	76676	76681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016025	GA	3	6	76716	76721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016025	CTG	2	6	76737	76742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016025	GTTC	2	8	76764	76771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016025	GC	3	6	77209	77214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016025	TGGGG	2	10	77261	77270	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016025	CGG	2	6	77407	77412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016025	GCG	2	6	77416	77421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016025	ACGC	2	8	77464	77471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016025	ATC	2	6	77496	77501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016025	TTC	2	6	77568	77573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016025	GGT	2	6	77617	77622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016025	TAC	3	9	77660	77668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016025	TTAC	2	8	77710	77717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016025	TTCT	2	8	77721	77728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016025	CTC	2	6	77779	77784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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268	NC_016025	AATC	2	8	128688	128695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_016025	CAG	2	6	128865	128870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_016025	GCG	2	6	135161	135166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_016025	GGC	2	6	135226	135231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_016025	CTG	2	6	135286	135291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_016025	GAT	2	6	135317	135322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016025	ACC	2	6	135328	135333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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296	NC_016025	AGA	2	6	135376	135381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_016025	TTG	2	6	150529	150534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_016025	CAC	2	6	184065	184070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_016025	GGGAA	2	10	184089	184098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_016025	GGT	2	6	190963	190968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
427	NC_016025	GCA	2	6	192794	192799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_016025	TCA	2	6	192833	192838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_016025	GC	5	10	192868	192877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
430	NC_016025	CAGG	2	8	192883	192890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
431	NC_016025	CGA	2	6	192915	192920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_016025	GGC	2	6	192928	192933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_016025	GGC	2	6	192938	192943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_016025	CAT	2	6	192966	192971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_016025	TTC	2	6	192972	192977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_016025	CGG	2	6	192979	192984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_016025	ACG	2	6	192985	192990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_016025	TG	3	6	193061	193066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
440	NC_016025	GC	3	6	193072	193077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NC_016025	CGC	2	6	193180	193185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_016025	CCA	2	6	193212	193217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_016025	GTG	2	6	193264	193269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_016025	ACC	2	6	193557	193562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
448	NC_016025	CTG	2	6	193598	193603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_016025	GCC	2	6	193659	193664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_016025	GCC	2	6	193747	193752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_016025	TCG	2	6	193758	193763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_016025	GCC	2	6	193880	193885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_016025	TTCA	2	8	193901	193908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
456	NC_016025	ATG	2	6	193922	193927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_016025	CG	3	6	194020	194025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
460	NC_016025	GCT	2	6	194038	194043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_016025	CCG	2	6	194047	194052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_016025	GCG	2	6	194056	194061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_016025	GC	4	8	194081	194088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_016025	GC	3	6	194108	194113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_016025	A	10	10	194132	194141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016025	CGA	2	6	194185	194190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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469	NC_016025	ACCG	2	8	198189	198196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
470	NC_016025	A	7	7	198255	198261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_016025	GTG	2	6	198287	198292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_016025	GGT	2	6	198297	198302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_016025	GGC	2	6	211682	211687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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489	NC_016025	TGC	2	6	211805	211810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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